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高通量平台工艺开发与筛选策略


随着生物制药行业的快速发展,高效、稳定的纯化工艺开发变得日益重要。高通量纯化技术通过并行实验与自动化手段,实现了对层析填料、缓冲液条件及工艺参数的大规模快速筛选与优化,显著提高了工艺开发的效率与可靠性。本文将系统介绍高通量纯化平台的核心目标、筛选策略,并结合实际案例说明其应用流程。



高通量纯化工艺平台开发的核心目标


  • 缩短开发周期: 通过并行实验和自动化技术,加速工艺参数优化与填料筛选。

  • 降低开发成本:减少样品和填料的消耗,优化资源利用率,降低工艺开发的经济负担。

  • 提高工艺稳健性:通过实验设计(DOE)和数据分析,明确关键工艺参数(CPP)与关键质量属性(CQA)的关联性,提升工艺的重复性和可控性。

  • 广泛的应用适应性:支持抗体、抗体偶联药物(ADC)、病毒载体,重组蛋白等新型生物药的纯化工艺需求。


高通量筛选策略

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填料筛选


亲和层析筛选策略


  • 目标产物特性分析:对目标产物的结构以及亲和力位点进行充分评估,如重组蛋白的标签类型、治疗性抗体的结构等。

  • 填料初选:依据目标产物特性选择亲和填料类型,如含镍离子的亲和填料用于捕获含组氨酸标签的重组蛋白,protein A或protein G亲和填料用于捕获含有完整抗体结构的抗体。

  • 初步筛选:选择3-4款该类型亲和填料进行筛选,采用平台化的层析方法,如抗体亲和层析通常选用100 mM的乙酸钠-乙酸/100 mM甘氨酸的缓冲液的洗脱目标产物,对目标产物的收率以及纯度进行检测。

  • 工艺优化:依据初步筛选结果进一步进行填料优化,结合相应的DOE实验设计,对上样、淋洗、洗脱等工艺参数进行优化。 


离子交换层析筛选策略


  • 确定层析目的与目标产物等电点:明确层析目的以及目标产物的等电点,目标产物的等电点可以通过目标产物序列计算获得,也可以通过毛细管等电聚焦电泳来获得。

  • 填料与模式选择:对于等电点低于目标产物等电点的杂质,可选用阴离子层析-流穿模式进行纯化;对于等电点高于目标产物等电点的杂质,通常可采用阳离子-结合洗脱的层析模式进行纯化。

  • 筛选方法:流穿模式的填料筛选通常可运用DOE结合96孔板的方式进行高通量筛选;结合洗脱模式的填料筛选首选柱层析筛选的方式。 


疏水层析筛选策略

  • 疏水性预实验:通过高盐梯度预实验确定目标分子疏水性,结合梯度洗脱优化疏水配基密度,可对目标产物的疏水性有一个预判。

  • 上样盐浓度优化:目标产物会在高盐体系下与疏水性填料进行结合,在低盐条件下进行洗脱,因此需要优化层析过程上样时的盐浓度,通常选用硫酸铵作为上样预处理的盐。

  • 填料筛选:初步确定配基种类和上样所需的盐浓度后,可以采用从高盐到低盐梯度洗脱的方式进行填料筛选和工艺优化,后续可以通过实验设计进一步优化为步级洗脱。


凝胶过滤层析筛选策略 

  • 分子量评估:首先要对目标产物以及杂质的分子量有个大致了解,可通过凝胶电泳、毛细管电泳等方法获得。

  • 填料选择:主要关注填料的孔隙直径范围,通常来说孔隙直径越大分离的范围也就越大,如Geldex® 75pg的孔隙较小,填料分离范围在3-70 kda,而Geldex® 200pg的孔隙较大,填料分离范围在10-600 kda,因此首先需要根据纯化需求选择合适的填料。

  • 特异性吸附:关注填料对目标产物的特异性吸附作用,应尽可能减少目标产物与填料的特异性吸附。  



缓冲液筛选 


缓冲液类型选择

根据目标蛋白的性质和纯化需求,选择合适的缓冲液类型,如磷酸盐缓冲液、Tris-HCl缓冲液、醋酸盐缓冲液等。 


参数梯度设计

对缓冲液的pH值、离子强度、盐浓度等参数进行梯度设置,如pH值可设置为5.5、6.0、6.5、7.0,7.5等,离子强度可设置为0.1 M、0.2 M、0.3 M等。 


高通量筛选实验

将不同参数的缓冲液分别用于填料的平衡、上样、冲洗和洗脱等步骤,通过检测蛋白的纯度、回收率、杂质去除率等指标,筛选出最佳的缓冲液条件。



工艺参数筛选


确定关键参数

如上样量、流速、洗脱梯度等,这些参数对纯化效果和工艺稳定性有重要影响。


实验方案设计

采用正交实验法、单因素实验法等DOE方法,对关键工艺参数进行组合设计,确定实验条件。 


数据驱动优化

在高通量平台上进行实验,收集各实验条件下的纯化结果,分析数据,筛选出最佳的工艺参数组合。




案例应用:某酵母分泌蛋白的

纯化工艺开发


某酵母的分泌表达上清:

  • 分子量:27 kda,

  • 等电点:9.90,

  • 疏水性适中,

  • 通过高通量筛选合适的实验条件,

  • 通过96孔板筛选预实验条件。


填料策略

百林科的填料为MaXtar® S,SP Chromstar® FF,MaXtar® MMC,MaXtar® MMC HR,MaXtar® Phenyl HR,MaXtar® butyl HR。


层析条件策略


离子层析缓冲液

A:PB+NaCl, pH7.0, 5 mS/cm;

B:PB+NaCl, pH7.5, 5 mS/cm;

C:PB+NaCl, pH7.0, 7 mS/cm;

D:PB+NaCl, pH7.5, 7 mS/cm;

E:PB+NaCl, pH7.0, 9 mS/cm;

F:PB+NaCl, pH7.5, 9 mS/cm.


疏水层析缓冲液

G:PB, pH7.0;

H:PB, pH7.5;

I:PB, 0.5 M (NH4)2SO4, pH7.0;

J:PB, 0.5 M (NH4)2SO4, pH7.5;

K:PB, 1 M (NH4)2SO4, pH7.0;

L:PB, 1 M (NH4)2SO4, pH7.5;

M:PB, 1.5 M (NH4)2SO4, pH7.0;

N:PB, 1.5 M (NH4)2SO4, pH7.5.


通过阳离子、复合层析及疏水层析的分离效果及工艺控制参数,选择合适的层析联用策略,并最终进行缓冲液和结合洗脱方式的优化,确定蛋白纯化的最佳纯化工艺。


结语

高通量平台工艺开发通过系统化的筛选策略和数据分析,显著提升了生物纯化工艺的效率与可靠性。本文提供的策略与案例可为类似项目的工艺开发提供参考,助力实现高效、低成本的产业化生产。


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